Ateroskleroz hastalarının Koroner Arter plaklarında uzun kodlama yapmayan RNA ların lncRNAs ifade düzeylerinin araştırılması

TÜBİTAK Projesi, 2015 - 2016

Proje Türü: TÜBİTAK Projesi
Başlama Tarihi: Nisan 2015
Bitiş Tarihi: Mayıs 2016

Proje Özeti

Koroner arter hastalığı dünyadaki ölümlerin önde gelen sebebini oluşturan yaygın kompleks bir hastalıktır. Koroner arter hastalığının en yaygın sebebi koroner arterlerdeki aterosklerozdur. Ateroskleroz damar duvarının yaralanmasına cevap olarak gelişen kronik inflamatuar bir hastalık olarak kabul edilir. Ateroskleroz Türkiye’ deki ölümlerin de %40’ ını oluştururken, 65 yaş üstü Avrupalı erkeklerde birincil ölüm nedeni kadınlarda ise ikincil ölüm nedeni olmaktadır. Kodlama yapmayan RNA aracılı epigenetik düzenlemeler uzun kodlama yapmayan RNA’lar (Long noncodingRNA, lncRNA) ve kısa kodlama yapmayan RNA’lar tarafından gerçekleştirilir. lncRNA’ ların gen düzenleme mekanizmaları hem gen ekspresyonunun aktivasyonu hem de inhibisyonu içermesi açısından daha kompleks bir yapıya sahiptir. Bu çalışmada dünyada ilk defa ateroskleroz hastalarının koroner arter plaklarında bazı uzun kodlama yapmayan RNA’ların ifade düzeyleri araştırılmıştır.

Son yıllarda yapılan klinik çalışmalarda internal mamalial arter greftlerinin bugün için koroner arter bypass cerrahisinde ideal greftlere en yakın greft olduğu belirlenmiştir. Bu çalışmada koroner arter by-pass cerrahisi sırasında aterosklerotik koroner arter ve internal mamalial arterden alınan doku örnekleri kullanılmıştır. Total RNA doku örneklerinin homojenizasyonundan sonra izole edilmiştir. Doku örneklerinde beş adet uzun kodlama yapmayan RNA’ların ifade düzeyleri RT-PCR kullanılarak ölçülmüştür. Mevcut çalışmada kardiyak patolojiyle ilişkili olduğundan şüphelenilen beş adet uzun kodlama yapmayan RNA araştırılmıştır. Bu lncRNA’ lar hipoksi indüklenebilen faktör 1A antisens RNA 2 (aHIF2), siklin bağımlı kinaz inhibitör 2B antisens RNA 1 (ANRIL), Potasyum voltaj-kapılı kanal, KQT-benzeri alt familyası,üye1 ters zincir/antisens transkript 1 (KCNQ1OT1), MI-İlişkili transkript (MIAT) ve Metastaz ilişkili akciğer adenokarsinom transkript 1 (MALAT1) dır.

Bu çalışmada aterosklerotik koroner arter ve aterosklerotik olmayan internal mamalial arter arasındaki uzun kodlama yapmayan RNA’ların ifade düzeyleri arasındaki farklılık karşılaştırılmıştır. ANRIL, MIAT,MALAT1 in koroner arter plaklarındaki ifade dağılımları internal mamalial arterdekine göre istatistiksel olarak anlamlı bulunmuştur. KCNQ ve HIF ın ifade dağılımları istatistiksel olarak anlamlı olmamakla birlikte kontrol grubuna göre iki genin ifadeside artmıştır. ANRIL, MIAT,MALAT1 in koroner arter plak gelişimi açısından belirteç olma özelliğindedİr