Determination and application of drug molecules that can have a synergistic effect with Carboplatin by using CRISPR scanning and imaging method in the treatment of ovarian cancer

TÜBİTAK Projesi, 2023 - 2024

Proje Türü: TÜBİTAK Projesi
Başlama Tarihi: Temmuz 2023
Bitiş Tarihi: Temmuz 2024

Proje Özeti

Yumurtalık kanseri dünyada yaygın olarak görülmekle beraber geç teşhis edilmesi durumunda iyileşme oranı düşmekte ve kansere bağlı ölümler gözlenebilmektedir. Bu araştırmada kullanılacak CRISPR Cas teknolojisi uygulamalarıyla Yumurtalık kanseri tedavisinde, tedavide etkili olabilecek genlerin ve epigenetik bilgilerin tespit edilmesi ve hangi genlerin ve epigenetik bilginin aktivitesinin inhibisyonu ile Yumurtalık kanserinde kullanılan Karboplatine karşı oluşabilecek direnç mekanizmalarının ortadan kaldırılması ya da azaltılması sayesinde daha efektif bir tedavinin sağlanması amaçlanmaktadır. Ayrıca CRISPR Cas görüntüleme ve tarama teknikleri sonucu elde edilen verilere dayanarak Karboplatine karşı oluşabilecek kimyasal direnç mekanizmaları aydınlatılarak Karboplatinle sinerjik etki gösterecek ilaç molekülü belirlenecek in vitro olarak yumurtalık kanseri hücre hatlarında ve in vivo olarak nude fare çalışmalarında uygulanacak ve sonuçlar değerlendirilecektir. Bu çalışmada kullanılacak CRISPR Cas deneysel prosedürlerin önemli bir çoğunluğu üzerine Ülkemizde çalışma yapılmamış olması, yöntemin ve elde edilecek sonuçların mevcut tedavi yöntemlerine önemli bir bakış açısı kazandırarak tedavinin daha etkili, güvenilir ve spesifik olması çalışmanın özgün değerini oluşturmaktadır. Proje süresince belirtmiş olduğum yöntemleri tecrübe ederek kanser tedavisinde genomik ve epigenomik çalışmaları ayrıntılı olarak inceleyerek bu alanda gerekli yetkinliği kazanmak istiyorum. Bu amaca yönelik CRISPR Cas uygulamalarını bu alanda çok değerli çalışmaları yürütmüş uzmanlardan ve çalışma ekibinden öğrenip tecrübe ederek Ülkemizde bu yöntemin uygulanabilirliğini sağlamak ve bu alanda katma değeri yüksek ve insan sağlığına değerli katkılar sunacak yeni buluşlara ve yöntemlere vesile olmak istiyorum. Proje kapsamında belirtmiş olduğum merkezde tecrübe kazanmakla beraber ülkemizde çok değerli bilim insanları ve hocalarımdan tecrübe ederek öğrenmiş olduğum bilgi ve deneyimlerimi orda bulunan bilim insanlarıyla paylaşarak bilgi alışverişinde bulunmayı hedeflemekteyim. Projemiz dahilinde gerçekleştireceğimiz çalışmalar ve elde edilecek bilimsel veriler ve yöntemler ülkemizde hemen hemen hiç çalışma yapılmamış bir alan olması nedeniyle bilimsel ve teknolojik araştırmalar adına özgün bir çalışma olarak katkı sağlayarak ülkemizde bu alanda çalışma yapacak bilim insanlarına ışık tutacak ve kanser tedavisine daha kapsamlı ve efektif bir bakış açısı kazanmalarını sağlayacaktır. Proje kapsamında öğrenilen ve deneyim kazanılan CRISPR Cas tarama ve genom/epigenom düzenleme yöntemlerini Ülkemize getirip gen mutasyonu kaynaklı kanserlerde bu yöntemlerin uygulanarak daha etkili ve hedefe yönelik bir kanser tedavisinin elde edilmesi ve elde edilen ürünlerin patent başvurusunda bulunulması planlanmaktadır.

Projenin yürütüleceği Robert H. Lurie Kanser Merkezi dünyanın en kapsamlı kanser araştırma merkezlerinden birisidir. Spesifik kanser çalışmalarında Robert H. Lurie Kanser Merkezi CRISPR Cas yöntemini ve uygulamalarını öğrenebileceğim en iyi merkezlerden biridir. Proje süresince Robert H. Lurie Kanser Merkezi Adlı Laboratuvarında bulunan tecrübeli çalışanlar ve cihaz altyapısı sayesinde çalışmalarımın sağlıklı bir şekilde yürütülebileceği öngörülmektedir. Araştırma merkezlerinde çalışabilmeme olumlu bakan ve danışmanlığımı kabul eden sayın Doçent Doktor Mazhar Adlı alanında oldukça etkin ve yenilikçi çalışmaları bulunan moleküler biyoloji ve genetik uzmanıdır.