Amaç:Enfeksiyöz gastroenterit salgınlarla seyredebilen küresel bulaşıcı hastalıktır. Akut gastroenteritlerin nedenleri arasında çok çeşitli bakteri, virüs ve parazitler bulunur. Çalışmamızda bölgemizdeki gastroenterit vakalarına neden olan bakteriyel etkenlerin dağılımının yanı sıra yaş ve mevsim gibi epidemiyolojik özelliklerini belirlemek, konvansiyonel metotlarla tespit edilmesi zor olan Campylobacter türlerinin multipleks gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu yöntemiyle gerçek sıklığına ışık tutmak amaçlandı. Gereç ve Yöntem:Ocak 2016 ve Ağustos 2019 tarihleri arasında hastanemizin çeşitli kliniklerinden bakteriyel etkenlerin saptanması amacıyla mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilen 7659 dışkı örneğinin bakteri paneli sonuçları geriye dönük olarak incelendi. Bulgular:Değerlendirilen olguların %21,7’si pozitif, %78,3’ü negatif saptandı. Pozitif örneklerin %92’sinde dört etkenden herhangi biri pozitif iken %7,9’unda 2 etken, %0,1’inde ise 3 etken birlikte pozitif saptandı. Tüm yaşlarda en çok tekli pozitif bulunan etken toplamda Campylobacter (%35,8) idi. Diğerleri sırayla Shiga toksin (%23,6 ), Shigella/ Enteroinvaziv E. coli (%22,3) ve Salmonella (%18,3) idi. Çocuklarda en sık Campylobacter (%43,6), erişkinlerde ise Shigella (%30,6 ) pozitif idi. Pozitiflik en sık yaz aylarında (%37,6) iken en az (%17,8) kış aylarında saptandı. Yaz aylarındaki en sık pozitif olan etken Campylobacter (%38,7), kış aylarında ise Shigella/ Enteroinvaziv E. coli (%39,7) olarak bulundu. Sonuç:Konvansiyonel yöntemlerle yapılan dışkı kültürlerinde özellikle Campylobacter türlerinin tanımlanmasında zorluklar yaşanmaktadır. Çalışmamız Campylobacter türlerinin neden olduğu gastroenteritlerin gerçek sıklığını belirlemek ve diğer etkenlerin bölgemizdeki dağılımının epidemiyolojik faktörlerden nasıl etkilendiğini göstermek açısından literatüre katkı sağlayacaktır. Diğer taraftan moleküler temelli yöntemler tanı açısından her ne kadar altın standart olarak kabul edilmese de, erken tanıya katkıda bulunarak ampirik tedaviye yön verebilir.
Objective:Infectious gastroenteritis is a global infectious disease that can be accompanied by outbreaks.Causes include a wide range of bacteria,viruses and parasites.In our study,we aimed to determine the distribution of bacterial agents that cause gastroenteritis cases in our region,their epidemiological characteristics,such as age and season.It is aimed to light the way on the true frequency of Campylobacter species,which are difficult to detect by conventional methods,by multiplex real-time polymerase chain reaction method. Material and method:Between January 2016 and August 2019,7659 stool samples sent to microbiology laboratory for detection of bacterial agents from various clinics of our hospital were retrospectively reviewed. Results:21.7% of the evaluated cases were positive and 78.3% were negative.In 92% of positive samples,any of the four agents were positive,while in 7.9% 2 agents and 0.1% 3 agents were positive together.Campylobacter(35.8%) was the most positive single agent at all ages.The others were Shiga toxin(23.6%),Shigella/Enteroinvaziv E. coli(22.3%) and Salmonella(18.3%),respectively. Campylobacter(43.6%) was most common in children and Shigella(30.6%) was positive in adults. Positivity was most common in summer(37.6%),while at least(17.8%) was detected in winter.Campylobacter(38.7%), the most frequently positive agent in summer,was found to be Shigella/ Enteroinvaziv E. coli(39.7%) in winter. Conclusion:There are difficulties in identifying Campylobacter species by conventional methods.Our study will contribute to the literature in terms of determining the true frequency of gastroenteritis caused by Campylobacter species and showing how the distribution of other agents in our region is influenced by epidemiological factors.On the other hand,although molecular-based methods are not accepted as the gold standard in terms of diagnosis,they may direct empirical treatment by contributing to early diagnosis.
