Böceklerde Mitogenom Transkripsiyonun Araştırılması: Eş Zamanlı Monosistronik Birimlere Dönüşme

Korkmaz E. M., Budak M.

3RD INTERNATIONAL BLACK SEA MODERN SCIENTIFIC RESEARCH, Samsun, Türkiye, 23 - 24 Mart 2023, ss.620-626

  • Yayın Türü: Bildiri / Tam Metin Bildiri
  • Basıldığı Şehir: Samsun
  • Basıldığı Ülke: Türkiye
  • Sayfa Sayıları: ss.620-626
  • Sivas Cumhuriyet Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

Böcek mitogenom verisi son yıllarda hızla artış sergilemiş olsa da, bu mitogenomlarıntranskripsiyonuna yönelik bilgilerimiz oldukça kısıtlıdır. Böceklerde mitokondriyaltranskripyon sonrası ilkin RNA’ların polisistronik birimler halinde sentezlendiğivarsayılmaktadır. Genellikle kararlı bir yapı sergileyip nad1/rrnS, nad2/nad3, nad5/nad4l venad6/ctyb olmak üzere dört farklı mitokondriyal polisistronik üniteden oluşmaktadır. Bupolisistronik ünitelerin tRNA uzaklaştırma mekanizması ile monosistronik birimlere farklızamanlarda dönüştükleri kabul edilmektedir. Ancak, bu süreç tam olarak bilinmemektedir. Buçalışmada, gül filiz arısı Syrista parreyssii (Spinola, 1843) (Hymenoptera: Cephidae) türündeampirik çalışmalara, derin RNA dizileme ve biyoinformatik yaklaşımlara başvurularak buörüntü test edilmiştir. Gül filiz arısında ampirik olarak mitokondriyal polisistronik birimlerinsaptanması amacıyla tasarlanan RNA tabanlı deneyler sonucunda, polisistronik birimlerinhalkasallaştırılamamış olması ve mitokondriyal transkriptom verisinin (derin RNA-seq verisi)biyoinformatik analizleri sonucunda polisistronik transkriptlere rastlanmamış olması, sentezaşamasında eş zamanlı monosistronik birimlere dönüştüğü sonucuna işaret etmiştir. Bu bulgu,veri bankalarında yer alan diğer böcek SRA verilerinin işlenmesi sonucunda dadesteklenmiştir. Eş zamanlı monosistronik birimlere dönüşme örüntüsü, verisetlerindegözlenen poliadenillenme (ağır zincirde) ve politiminlenme (hafif zincirde) mekanizmasınınvarlığı ile de desteklenmiştir