Kırım-Kongo Kanamalı Ateşi Hastalarında hsa-miR-1908 ve hsa-miR-144 İfade Düzeylerinin Araştırılması


Creative Commons License

aldemir ö., Engin A., Bayyurt B., Arslan S.

Mikrobiyoloji Bülteni, cilt.58, sa.3, ss.321-333, 2024 (SCI-Expanded) identifier identifier identifier

  • Yayın Türü: Makale / Tam Makale
  • Cilt numarası: 58 Sayı: 3
  • Basım Tarihi: 2024
  • Doi Numarası: 10.5578/mb.202497188
  • Dergi Adı: Mikrobiyoloji Bülteni
  • Derginin Tarandığı İndeksler: Science Citation Index Expanded (SCI-EXPANDED), Scopus, BIOSIS, TR DİZİN (ULAKBİM)
  • Sayfa Sayıları: ss.321-333
  • Sivas Cumhuriyet Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

Kırım-Kongo kanamalı ateşi (KKKA), kene kaynaklı zoonotik viral bir hastalıktır. Gen ifadesinin düzenlenmesinde önemli bir rol oynayan mikroRNA (miRNA)’lar gelişme, farklılaşma, sağkalım, apoptoz ve yaşlanma gibi hücre yaşamı için gerekli olan birçok süreçte rol almaktadır. miRNA’lar işlevlerini yerine getiremedikleri takdirde viral enfeksiyonlar dahil birçok hastalığa yatkınlığa neden olurlar veya hastalığın ağır ya da hafif olmak üzere farklı klinik tablolarda geçirilmesine yol açarlar. Bu çalışmada, KKKA hastalarında hsa-miR-144 ve hsa-miR-1908 ifade düzeylerinin belirlenmesi ve farklı klinik KKKA tablolarında karşılaştırılması amaçlanmıştır. Bu çalışmada 60 KKKA hastası ve 40 sağlıklı bireyden alınan kan örneklerinde hsa-miR-144 ve hsamiR-1908 ifade düzeyleri kantitatif revers transkripsiyon polimeraz zincir reaksiyonu (RT-qPCR) yöntemiyle saptanmıştır. Ayrıca hastalığı şiddetli geçirenler ile şiddetli olmayanlar ya da ölen olgular ile yaşayan hastalar arasında, araştırılan miRNA ifade düzeylerinde herhangi bir fark olup olmadığı araştırılmıştır. RT-qPCR verileri “Veri Analiz Merkezi”ne (Qiagen, Almanya) yüklenmiş ve ΔΔCq (ΔΔCt) yöntemi kullanılarak analiz yapılmıştır. p değeri, çalışma gruplarındaki genler için Student’s t testine göre hesaplanmıştır. KKKA hastalarında kontrol grubuna göre hsa-miR-144 ifade düzeyinin azaldığı (kat değişimi= 0.09) ve hsa-miR-1908 ifade düzeyinin 1.44 kat arttığı belirlenmiştir. Hsa-miR-144 ve hsa-miR-1908’in ifadesinin, şiddetli olmayan hastalara kıyasla şiddetli hastalarda sırasıyla 2 ve 2.36 kat arttığı bulunmuştur. hsa-miR-144 ve hsa-miR-1908’in ifade düzeyleri hayatta kalan hastalarla karşılaştırıldığında ölen olgularda sırasıyla 16.3 ve 14.3 kat yüksek olup bu sonuçlar istatistiksel olarak anlamlı bulunmuştur. Ek olarak, düşük lökosit sayısı olan hastaların hsa-miR-144 ifade düzeyi istatistiksel olarak anlamlı derecede azalmış ve hsa-miR-1908 ifade düzeyi, protrombin zamanı (PT) uzamış hastalarda istatistiksel olarak anlamlı şekilde artmıştır. Bu çalışma literatürde KKKA hastalarında hsa-miR-1908 ifade düzeyini araştıran ilk çalışmadır. Sonuç olarak, bu çalışmanın verileri hsa-miR-144 ve hsa-miR-1908’in, KKKA hastalığının prognoz ve klinik seyrinin öngörülmesinde önemli bir biyobelirteç olabileceğini düşündürmektedir.
Crimean-Congo hemorrhagic fever (CCHF) is a tick-borne zoonotic viral disease. MicroRNAs (miRNAs), which play an important role in the regulation of gene expression, are involved in many processes essen- tial for cell life such as development, differentiation, survival, apoptosis and aging. If miRNAs fail to fulfill their functions, they cause susceptibility to many diseases, including viral infections or cause the disease to be experienced in different clinical situations, such as severe or mild. In this study, we aimed to determine the expression levels of hsa-miR-144 and hsa-miR-1908 in CCHF patients and to compare the results in different clinical courses of CCHF disease. In this study, expression levels of hsa-miR-144 and hsa-miR-1908 were detected by quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (RT-qPCR) in blood sam- ples obtained from 60 CCHF patients and 40 healthy individuals. We also investigated the differences in the expression levels of the microRNAs between patients with severe and non-severe disease or between patients who died and survived. Quantitative polymerase chain reaction data were uploaded to the “Data Analysis Center” (Qiagen, Germany) and analyzed using the ΔΔCq (ΔΔCt) method. p value was calculated according to Student’s t test for genes in the study groups. The expression level of hsa-miR-144 decreased (fold change= 0.09) and the expression level of hsa-miR-1908 increased 1.44-fold in CCHF patients com- pared to the control group. The expression of hsa-miR-144 and hsa-miR-1908 increased 2 and 2.36-fold, respectively, in severe patients compared to non-severe patients. The expression levels of hsa-miR-144 and hsa-miR-1908 were 16.3- and 14.3-fold higher, respectively, in fatal cases compared to surviving patients and these results were statistically significant. In addition, the expression level of hsa-miR-144 was significantly decreased in patients with low leukocyte counts and the expression level of hsa-miR-1908 was significantly increased in patients with prolonged prothrombin time (PT). This is the first study in the literature investigating the expression level of hsa-miR-1908 in CCHF patients. In conclusion, the data of this study suggest that hsa-miR-144 and hsa-miR-1908 may be important biomarkers in predicting the prognosis and clinical course of CCHF disease.