Neodiprion sertifer (Hymenoptera:Diprionidae) türünün total mitokondri genomu üzerine araştırmalar


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, MOLEKÜLER BİYOLOJİ VE GENETİK ANABİLİM DALI, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2015

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: MERVE NUR ÖRDEK

Danışman: ERTAN MAHİR KORKMAZ

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Hymenoptera takımı böcek takımları arasında, biyolojik yaşam çeşitliliği ve tür zenginliği açısından ilk sırada yer alan takımlardan biridir. Birçok evrimsel ve biyocoğrafik örüntünün saptanmasına yönelik çalışmalarda model bir grup olarak kabul edilmektedir. Bu çalışmalarda moleküler yöntemler önemli oranda kullanılmakta ve belirteç olarak da birçok avantajlı özelliğinden dolayı mitokondriyal DNA'ya başvurulmaktadır. Moleküler ekoloji çalışmalarında mtDNA'nın popüleritesi, mtDNA'nın birkaç temel özelliğine bağlıdır. Bunların başında, mitogenomun nispeten küçük olması, bol miktarda bulunması, izolasyonunun kolay olması ve anasal kalıtım sergilemesi sayılabilir. Bu çalışma kapsamında Neodiprion sertifer (Hymenoptera: Diprionidae) türünün total mitogenom verisi elde edilerek karakterize edilmiştir. N. sertifer mitogenomunda fazladan bir tRNA geni (trnM) içermesi ve iki gen yeniden düzenlenmesi (trnQ ve trnM) sergilemesi dışında korunmuş gen düzenlenmesine sahiptir. Ayrıca atasal pancrustacea mitogenomuna göre düzensizleşme eğilimi ve genom genelinde sergilediği AC eğilimi ilgili türde mitogenomun yüksek evrimleşme hızı sergilediğine işaret etmektedir. Bunun yanında ilgili genom, özellikle yapısal fonksiyonu olan sekonder yapı kazanan RNA elemanlarını koruma eğilimi sergilemektedir. Ayrıca replikasyon ve transkripsiyonda fonksiyonel olan genetik elemanlar da oldukça korunmuştur. Türün total mitogenom verisinin elde edilmesiyle takım içerisinde, özellikle de Symphyta alttakımında mitogenom evriminin anlaşılmasında önemli veriler sağlar.