PD-L1 Geni Susturulmuş Mide Kanseri Hücrelerinde Dosetaksel İlacının Antikanser Aktivitesi ile Hücre Döngüsü ve Apoptozis Genleri Arasındaki İlişkinin Araştırılması


Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri Bölümü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2023

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: CEMİLE ZONTUL

Danışman: Yavuz Siliğ

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bu çalışmada, PD-L1 geni susturulmuş AGS mide kanseri hücre hatlarında, dosetaksel ilacının sitotoksik aktivitesi ve MYC, CASP2, Tp53, RAD51, BRCA2, MDM2 ve BAX genlerinin ekspresyon düzeyleri, apoptoz üzerine etkisinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmamızda öncelikle hücre döngüsü ve apoptozda görevli proteinlerin birbirleriyle ve PD-L1 geni ile etkileşimini belirlemek için String v11 programı kullanıldı. Analiz sonucunda PD-L1 proteininin MYC, CASP2, Tp53, RAD51, BRCA2, MDM2 ve BAX proteinleri ile etkileşimleri belirlendi. Mide kanseri teşhisi alan ve ameliyat olan hastalardan alınan doku örneklerinde PD-L1, MYC, CASP2, Tp53, RAD51, BRCA2, MDM2 ve BAX genlerinin ekspresyon düzeyleri tespit edildi. Dosetaksel ilacı AGS hücre hattına sekiz farklı konsantrasyonda (1-100 µg/mL) 24, 48 ve 72 saat süreyle uygulanmış ve antikanser aktiviteleri MTT yöntemi ile belirlenerek IC50 değeri hesaplandı ve hücrelere uygulandı, RNA izole edildi ve cDNA sentezlendi. siRNA havuzu ile PD-L1 geni susturuldu. RT-PCR cihazında ∆∆CT yöntemi kullanılarak hücre döngüsü, apoptoz genleri ve PD-L1 geninin ekspresyon düzeyleri analiz edildi. PD-L1 geni susturulmuş ve dosetaksel uygulanmış hücrelerde apoptotik cisimcikleri belirlemek için DAPi boyama işlemi gerçekleştirildi. Mide kanseri tümör dokularında BRCA2, BAX, RAD51 genlerinin ekspresyonu kontrol grubuna kıyasla azaldığı; PD-L1, MDM2, MYC, CASP2, TP53 genlerinin ise kontrol grubuna kıyasla arttığı tespit edildi. PD-L1 siRNA transfekte edilmiş AGS hücre hattında PD-L1, MDM2, BRCA2, BAX, MYC, CASP2, Tp53 genlerinin ekspresyonunun kontrol grubuna kıyasla azaldığı, RAD51 geninin ise kontrol grubuna kıyasla arttığı tespit edilmiştir. Sonuç olarak mide kanseri tedavisinde PD-L1 genin susturulması ve DTX ile kombine tedavi umut vericidir. Ancak, konuyla ilgili daha kapsamlı in vitro ve in vivo çalışmalara ihtiyaç duyulmaktadır.