Sivas yöresinden izole edilen Francisella tularensis subsp. holarctica izolatlarının moleküler filogenetik analizi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2018
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: SİNEM DEMİR
Danışman: Mehmet Ataş
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Francisella tularensis insanlarda ve hayvanlarda Tularemi hastalığına neden olan fakültatif intrasellüler bir bakteridir. Tularemi hastalığına alt tür tularensis ve alt tür holarctica neden olmaktadır. F. tularensis subsp. tularensis yalnızca Kuzey Amerika' da bulunurken, F. tularensis subsp. holarctica ise Avrupa ve Asya ülkelerinden izole edilmektedir. Ülkemizdeki tularemi salgınlarının su kaynaklı olduğu ve etkenin F. tularensis subsp. holarctica olduğu bilinmektedir. 2011-2012 yıllarında Sivas ilinde gözlenen tularemi salgın bölgelerindeki su örneklerinden kültür yöntemi ile sekiz F. tularensis subsp. holarctica izole edilmiştir. Bu çalışmada izole edilen sekiz F. tularensis subsp. holarctica izolatının tul4, fopA, RD1 ve 16S rRNA gen bölgeleri PCR yöntemi ile çoğaltılmış ve sekans analizi yöntemiyle araştırılmıştır. Sekans analizi yapılan gen bölgeleri birbirleri ile ve GenBank' ta bulunan örnekler ile karşılaştırılmıştır. Tüm örnekler tul4 ve fopA gen bölgesi açısından benzer bulunmuştur. 16S rRNA gen bölgesi açısından dört izolat, RD1 gen bölgesinde ise iki izolat benzer bulunmuştur. İncelen gen bölgeleri açısından GenBank' ta yapılan sekans karşılaştırmasında F. tularensis subsp. holarctica LVS ve F. tularensis subsp. holarctica PHIT-FT049 örnekleri ile % 95-100 benzerlik saptanmıştır. Çalışmamız sonucunda; sekiz F.tularensis subsp. holarctica izolatının tul4 ve fopA gen bölgelerinin özdeş olduğu, ilimizdeki tularemi salgınlarında 16S rRNA ve RD1 gen bölgeleri bakımından benzer ve farklı baz dizilimine sahip kökenlerin bulunduğu ortaya konulmuştur. F.tularensis'in ülkemizdeki filocoğrafyasının detaylı olarak ortaya çıkarılabilinmesi için salgın bölgelerinden yeni izolatların üretilmesi ve ileri moleküler teknikler ile araştırılması gerekmektedir.