Farklı kınkanatlı (Insecta: Coleoptera) üyelerinde defensin geninin gen anatomisinin belirlenmesi, evrimsel öyküsünün çıkarımı ve gen ürünlerinin antimikrobiyal aktivitelerinin sınanması
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, MOLEKÜLER BİYOLOJİ VE GENETİK ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2022
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: AYŞE NUR PEKTAŞ
Danışman: ERTAN MAHİR KORKMAZ
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Antimikrobiyal peptidler omurgalı ve omurgasız hayvanların anasal bağışıklık sistemlerinde önemli rol oynamaktadır. Antimikrobiyal peptidler hızlı bir şekilde, düşük metabolik maliyetle sentezlenirler, kolaylıkla büyük miktarlarda depolanır ve bir enfeksiyon durumunda kısa sürede hazır hale gelip geniş bir mikrop yelpazesini hızla nötralize ederler. Bu peptidlerin fonksiyonlarının nasıl olduğu, sentezlerinin ne zaman ve nerede gerçekleştiğinin öğrenilmesi yeni terapötik ajanların geliştirilmesi, özellikle konvansiyonel antibiyotiklere karşı gelişen mikrobiyal direnç açısından önemli hale gelmiştir. Bu tez çalışması kapsamında, eklembacaklılarda en yaygın olarak karakterize edilen antimikrobiyal molekül sınıfı olan defensinler kınkanatlı böceklerden dört türde araştırılmıştır. Böcek defensinlerinin peptid dizisi elde edilerek yapısal analizleri yapılmıştır. Defensin peptidinin kimyasal formları %95 üzeri saflıkta sentezlenerek antimikrobiyal aktiviteleri MIC testi ile sınanmıştır. Antimikrobiyal aktivitenin hücre bütünlüğünü nasıl bozduğunun gösterilmesi için SEM tabanlı fotoğrafları çekilmiştir. Çalışma sonucunda, dört adet defensin peptidinin dizileri belirlenerek GenBank veritabanına eklenmiştir. Yapısal analizleri tamamlanarak üç boyutlu yapıları çizilmiştir. Bu peptidlerden Mylabris quadripunctata defensinin S. aureus ve MRSA'ya karşı, Sphaeridium marginatum ve Harpalus rufipes defensinlerinin de Candida tropicalis'e karşı antimikrobiyal aktivite gösterdiği tespit edilmiştir. Anahtar kelimeler: antimikrobiyal peptid, böcek, defensin, Coleoptera, RACE, MIC, SEM, Shrödinger